Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BcrQ6PAJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BcrQ6PAJ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BcrQ6PAJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BcrQ6PAJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BcrQ6PAJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BcrQ6PAJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BcrQ6PAJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms