Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sik3Q6P4S6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sik3Q6P4S6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sik3Q6P4S6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sik3Q6P4S6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sik3Q6P4S6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sik3Q6P4S6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms