Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38,4■■■■□ 3,74
Slx4Q6P1D7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Slx4Q6P1D7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38,37■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38,34■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Slx4Q6P1D7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38,29■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38,28■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Slx4Q6P1D7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,22■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38,2■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Slx4Q6P1D7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Slx4Q6P1D7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38,11■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38,1■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38,07■■■■□ 3,69
Slx4Q6P1D7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Slx4Q6P1D7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37,99■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37,98■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Slx4Q6P1D7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,66
Slx4Q6P1D7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37,86■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37,85■■■■□ 3,65
Slx4Q6P1D7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,7 ms