Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn12Q6JVL5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn12Q6JVL5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Lcn12Q6JVL5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lcn12Q6JVL5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lcn12Q6JVL5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms