Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd1cQ69ZK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd1cQ69ZK6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jmjd1cQ69ZK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms