Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgefl1Q68EF8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgefl1Q68EF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgefl1Q68EF8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgefl1Q68EF8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgefl1Q68EF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgefl1Q68EF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgefl1Q68EF8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgefl1Q68EF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rapgefl1Q68EF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rapgefl1Q68EF8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rapgefl1Q68EF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms