Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab3ipQ68EF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3ipQ68EF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3ipQ68EF0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3ipQ68EF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms