Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp4fQ66X05 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4fQ66X05 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp4fQ66X05 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4fQ66X05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4fQ66X05 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms