Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80dQ66JY2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80dQ66JY2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80dQ66JY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80dQ66JY2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80dQ66JY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80dQ66JY2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms