Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs2Q66JT5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpgs2Q66JT5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpgs2Q66JT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpgs2Q66JT5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpgs2Q66JT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpgs2Q66JT5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms