Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf1Q64213 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf1Q64213 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf1Q64213 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf1Q64213 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf1Q64213 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms