Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr2e1Q64104 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr2e1Q64104 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nr2e1Q64104 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr2e1Q64104 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr2e1Q64104 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nr2e1Q64104 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms