Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ccdc18Q640L5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc18Q640L5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ccdc18Q640L5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc18Q640L5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Ccdc18Q640L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc18Q640L5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
Ccdc18Q640L5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ccdc18Q640L5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Ccdc18Q640L5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Ccdc18Q640L5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
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