Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PatjQ63ZW7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PatjQ63ZW7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PatjQ63ZW7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PatjQ63ZW7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PatjQ63ZW7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PatjQ63ZW7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PatjQ63ZW7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms