Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm20854Q62461 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gm20854Q62461 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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