Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20854Q62461 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20854Q62461 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20854Q62461 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms