Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf6Q62311 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf6Q62311 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Taf6Q62311 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf6Q62311 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf6Q62311 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf6Q62311 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf6Q62311 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Taf6Q62311 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf6Q62311 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf6Q62311 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf6Q62311 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf6Q62311 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf6Q62311 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf6Q62311 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf6Q62311 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf6Q62311 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf6Q62311 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf6Q62311 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf6Q62311 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms