Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim27Q62158 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim27Q62158 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim27Q62158 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim27Q62158 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim27Q62158 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim27Q62158 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim27Q62158 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim27Q62158 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim27Q62158 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim27Q62158 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms