Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Gli3Q61602 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Gli3Q61602 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gli3Q61602 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gli3Q61602 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Gli3Q61602 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gli3Q61602 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gli3Q61602 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gli3Q61602 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gli3Q61602 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gli3Q61602 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gli3Q61602 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Gli3Q61602 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Gli3Q61602 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gli3Q61602 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Gli3Q61602 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Gli3Q61602 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gli3Q61602 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gli3Q61602 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Gli3Q61602 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Gli3Q61602 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms