Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sim1Q61045 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sim1Q61045 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sim1Q61045 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sim1Q61045 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sim1Q61045 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sim1Q61045 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sim1Q61045 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms