Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin1Q60865 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Caprin1Q60865 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caprin1Q60865 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Caprin1Q60865 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms