Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r1bQ60829 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r1bQ60829 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp1r1bQ60829 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r1bQ60829 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r1bQ60829 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r1bQ60829 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r1bQ60829 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms