Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Epha1Q60750 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Epha1Q60750 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Epha1Q60750 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Epha1Q60750 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Epha1Q60750 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Epha1Q60750 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms