Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Sik1Q60670 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Sik1Q60670 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sik1Q60670 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sik1Q60670 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sik1Q60670 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sik1Q60670 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sik1Q60670 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31,31■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Sik1Q60670 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Sik1Q60670 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Sik1Q60670 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms