Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Akap4Q60662 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Akap4Q60662 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Akap4Q60662 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Akap4Q60662 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Akap4Q60662 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Akap4Q60662 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Akap4Q60662 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms