Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd200r3Q5UKY4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd200r3Q5UKY4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd200r3Q5UKY4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd200r3Q5UKY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms