Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc125Q5U465 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc125Q5U465 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc125Q5U465 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc125Q5U465 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc125Q5U465 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms