Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znrf3Q5SSZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Znrf3Q5SSZ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znrf3Q5SSZ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znrf3Q5SSZ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Znrf3Q5SSZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znrf3Q5SSZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1503.4 ms