Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TefmQ5SSK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TefmQ5SSK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefmQ5SSK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefmQ5SSK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TefmQ5SSK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms