Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88aQ5SNZ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc88aQ5SNZ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms