Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trav8d-2Q5R1B6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trav8d-2Q5R1B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav8d-2Q5R1B6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trav8d-2Q5R1B6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trav8d-2Q5R1B6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms