Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCH9

Grm6, Metabotropic glutamate receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grm6Q5NCH9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grm6Q5NCH9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Grm6Q5NCH9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grm6Q5NCH9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grm6Q5NCH9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Grm6Q5NCH9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grm6Q5NCH9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grm6Q5NCH9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms