Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttf2Q5NC05 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttf2Q5NC05 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttf2Q5NC05 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttf2Q5NC05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttf2Q5NC05 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttf2Q5NC05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms