Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp36l3Q5ISE2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp36l3Q5ISE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp36l3Q5ISE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp36l3Q5ISE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp36l3Q5ISE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp36l3Q5ISE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms