Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn2bQ56A07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn2bQ56A07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2bQ56A07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn2bQ56A07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn2bQ56A07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn2bQ56A07 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms