Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
1700123L14RikQ3V2K7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
1700123L14RikQ3V2K7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1700123L14RikQ3V2K7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
1700123L14RikQ3V2K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
1700123L14RikQ3V2K7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
1700123L14RikQ3V2K7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
1700123L14RikQ3V2K7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
1700123L14RikQ3V2K7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
1700123L14RikQ3V2K7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
1700123L14RikQ3V2K7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms