Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Samd5Q3V1H9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Samd5Q3V1H9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Samd5Q3V1H9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19,85■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
Samd5Q3V1H9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19,79■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Samd5Q3V1H9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Samd5Q3V1H9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,6 ms