Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930432M17RikQ3V0W9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930432M17RikQ3V0W9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930432M17RikQ3V0W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms