Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C3

Nutm2, NUT family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nutm2Q3V0C3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nutm2Q3V0C3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nutm2Q3V0C3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nutm2Q3V0C3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nutm2Q3V0C3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutm2Q3V0C3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nutm2Q3V0C3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nutm2Q3V0C3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nutm2Q3V0C3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms