Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnpc3Q3UZ01 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnpc3Q3UZ01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnpc3Q3UZ01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnpc3Q3UZ01 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms