Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Elf3Q3UPW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Elf3Q3UPW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Elf3Q3UPW2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Elf3Q3UPW2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elf3Q3UPW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elf3Q3UPW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elf3Q3UPW2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elf3Q3UPW2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms