Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rmi2Q3UPE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rmi2Q3UPE3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmi2Q3UPE3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms