Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nhlrc4Q3UP44 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nhlrc4Q3UP44 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nhlrc4Q3UP44 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlrc4Q3UP44 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlrc4Q3UP44 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms