Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem253Q3UNB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem253Q3UNB8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem253Q3UNB8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem253Q3UNB8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem253Q3UNB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem253Q3UNB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem253Q3UNB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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