Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc61Q3UJV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc61Q3UJV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc61Q3UJV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc61Q3UJV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc61Q3UJV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms