Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc34Q3UI66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc34Q3UI66 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc34Q3UI66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc34Q3UI66 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc34Q3UI66 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms