Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops9Q3U898 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops9Q3U898 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cops9Q3U898 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms