Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssbp4Q3U4B1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssbp4Q3U4B1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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