Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TchpQ3TVW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TchpQ3TVW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TchpQ3TVW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TchpQ3TVW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms