Protein–RNA interactions for Protein: Q3TV65

Mpnd, MPN domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpndQ3TV65 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MpndQ3TV65 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MpndQ3TV65 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MpndQ3TV65 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MpndQ3TV65 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MpndQ3TV65 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MpndQ3TV65 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
MpndQ3TV65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MpndQ3TV65 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
MpndQ3TV65 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
MpndQ3TV65 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MpndQ3TV65 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MpndQ3TV65 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms