Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21440Q3TTD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm21440Q3TTD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21440Q3TTD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms